治療阿米巴性陰道炎最常用的藥物為滅滴靈。每次0.2～0.4克，每日3次，10～14天為1療程；也可同時將滅滴靈塞入陰道內局部治療，每次1～2片，每日1次。也可服用喹碘方，本藥能殺滅阿米巴滋養體，每次0.5～0.75克，每日3次。